水冷型冷冻式干燥机的冻洁方式一般分成低温快冻、低温慢冻。

低温快冻（10~15℃／分）针对保质保量有益，产生的微结晶，得到的产品外观好，融解速率也快，但产生微结晶则不利于加速冻干速率。

低温慢冻（1℃／分）产生粗结晶，对提高冻干效率有益，可是慢冻一般产品品质，尤其是含活性的酶类或活菌活病毒等成活率极其不好。

针对合成物，快冻和慢冻的需求不是严格，此两种方法均可。

水冷型冷冻式干燥机的升华方法：

一次提升法：一般适用制品的共溶点需在-10～-20℃左右，及其构造单一，黏度、浓度均不高，设备在10mm薄厚或15mm厚度。只要将产品温度降低到其互融点下列-10℃～-21℃即可加温提升，在加温提升环节中需控制好提温速度，可保证产品干躁成功。

反复预冻提升法：一些共溶点较低的产品，即便很低的温度下也无法达到冻洁。外收看好像早已冻洁全部，但在提升环节中，通常冻块变软，产生气泡，并在制品表层产生粘稠状网状结构，影响升华干燥地进行，如蜂蜜、蜂皇浆等其物质结构比较复杂，又粘稠的产品通常不易冻洁，在提升中出现上述情况。可采取反复预冻方式去解决。运用此种方式，可提高冻干效率，也改进了制品的品质，减少冻干周期。

分隔冻洁提升法：在冻干中如用大盘子装产品，并且薄厚偏厚或浓度过高，在提升时，底边的水蒸气没法运用逸出，使全部冻块形变而脱开盘底，可将装制品的菜盘开展分隔，同时提升热传导效率。